encime (encimi) - z visoko molekulsko maso organske spojine proteinske narave, organ, ki opravlja vlogo bioloških katalizatorjev.
mehanizem delovanja encimov
osvetliti mehanizme, ki so podlaga za katalitično delovanje encimov je eden od temeljnih problemov, in ne samo pereči problemi encimologije, vendar moderno biokemija in molekularna biologija.
Dolgo preden je postal razpoložljive čiste encime in pojasnil, njihovo naravo, so postali prepričani, da je ključnega pomena za izvajanje procesa encimske povezavo s substratom encima.Poskusi, da zazna encim kompleksirana s substratom za dalj časa ni privedla do uspeha, saj je ta kompleks labilna, da je zelo hitro razpade.Uporaba spektroskopijo je bilo mogoče identificirati encim substrat kompleksi za katalaze, peroksidaze, alkohol, flavinzavisimyh encimov.
analitsko metodo rentgenske dobimo veliko pomembnih podatkov o strukturi in katalitskim mehanizmov delovanja encimov.Ta metoda je bila uporabljena za določitev povezave substrata analoge za encime lizocim in himotripsin.
Nekateri neposreden dokaz za obstoj encim substrata kompleksov uspelo tja, kjer je ena izmed faz katalitskega ciklusa encim vezan na substrat s kovalentno vezjo.Primer je reakcija hidrolize n-nitrofenil acetat katalizira kemotripsina.Pri mešanju z encimom kemotripsina etru acetiliramo na hidroksilno skupino ostanka reaktivne serin.Ta faza je hiter, vendar atsetilhimotripsina hidroliza da tvorijo acetat in prosti kemotripsina je precej počasnejši.Zato, v prisotnosti n-nitrophenylacetate nabira atsetilhimotripsin se da zlahka odkriti.
substrat v prisotnosti encima sestavka lahko "catch" preko prenosa kompleksnega nestabilno EU v neaktivno obliko, na primer z obdelavo encim-substrat kompleks, natrijevim borohidridom, močno zmanjšuje učinek.Tako kompleksen kot stabilne kovalentne derivat je bila odkrita v encimski aldolase.Ugotovljeno je bilo, da je substrat molekule reagira s skupino e-amino lizina.
substrat reagira z encimom v določenem delu, ki se imenuje aktivna središče ali jedro encima.Pod
aktivne centra, ali jedro, realizirati encim proteinski del, ki se veže na substratu (kofaktorjev) in povzroči encimske lastnosti molekule.Aktivno mesto določa specifičnost in katalitično aktivnost encima bi morala biti določena stopnja težavnosti strukturi prilagojena za neposredni pristop in interakcijo s substratom molekule, ali njegovi deli, ki neposredno sodelujejo pri reakciji.
razlikovati med funkcionalne skupine vključene v "katalitsko aktivne" del encima, ki tvori odsek posledico specifično afiniteto (vezavo substrata na encim) - ti zatič ali "sidro" (ali adsorpcija oddelka aktivnega mesta encima).
Mehanizem delovanja encima teorije pojasnjuje Michaelis-Menten.Glede na to teorijo, da postopek poteka v štirih korakih.
mehanizem delovanja encimov: I oder
med substratom (S) in encima (E) dobili povezave - tvorjena encim-substrat kompleks EU, v katerem so komponente povezana s kovalentnimi, ionskim, vodo in druge vezi.
mehanizem delovanja encimov IІ oder
substrat pod vplivom povezanega encima se aktivira in postane na voljo ustreznih reakcij katalize EU.
mehanizem delovanja encimov IІI oder
kataliza zavezuje EU.Ta teorija je potrjena z eksperimentalnimi študijami.
Nazadnje je faza IV označen s sprostitvijo encimskega E in reakcijske produkte R. sekvence transformacij se lahko prikaže na naslednji način: E + S - EU - EU * - E + P.
specifičnost encima akcijskega
Vsak encim deluje na določen substrat, ali za skupino snovi, ki imajo podobno strukturo.Specifičnost encimskega delovanja je zaradi podobnosti konfiguracije aktivnega mesta in substratom.V procesu interakcij tvori encim-substrat kompleksa.
